Вченим вдалось створити нове програмне забезпечення, що виводить дослідження вірусів, бактерій та клітин людського тіла на новий рівень. Програмне забезпечення назване cellPACK і за його допомогою вже було продемонстровано можливість моделювання ВІЛ.
У дослідженні, опублікованому в журналі Nature Methods, дослідники продемонстрували, як програма cellPACK може бути використана для моделювання вірусів таких, як ВІЛ.
Програмне забезпечення cellPACK вирішує головну проблему структурної біології. Хоча вчені розробили методи як для вивчення відносно великих структур таких, як клітини, так і для дуже дрібних структур таких, як білки - було важко візуалізувати структури в "мезомасштабі".
Програмне забезпечення cellPACK дозволяє вченим швидко та ефективно оброблювати отримані на більш дрібних структурах дані та створювати на їх основі моделі більших розмірів. Раніше цей процес виконувався вручну та тривав значний період в часі. З новим програмним продуктом все проходить в автоматичному режимі та за лічені години.
Розпочате як дипломний проект студента Грема Джонсона (Graham Johnson) з інституту TSRI (The Scripps Research Institute), програмне забезпечення cellPACK сьогодні є безкоштовним з відкритим кодом. Долучитися до його вдосконалення може кожен охочий, скориставшись сайтом продукту http://www.autopack.org.
Стаття підготовлена командою проекту INFORUM.IN.UA за матеріалами TSRI
